Monthly Archives: March 2026
作者身份与利益冲突表(Authorship and COI Form)and 出版许可协议说明 (License Agreement)
登录系统 https://cts.sciencemag.org
感谢您配合填写 作者身份与利益冲突声明表。
注意事项:
- 每个问题都必须回答
- 您可以随时保存并稍后继续填写
- 在提交之前,编辑部无法看到该表格
提交方式:
点击表格末尾的 “Save and Submit” 按钮。
该表格 必须完成后论文才能被接收。
我们建议您尽快完成填写,以便在论文仍在处理期间解决任何问题。
请确保以下信息已经或将会提供给通讯作者,并体现在论文的所有版本中:
- 作者贡献
- 资金来源
- 竞争利益声明
- 数据与材料可获取性的限制(如有)
请填写作者贡献(CRediT 贡献分类)
请使用下拉菜单选择您在论文中的贡献角色。
如果系统已经识别到部分角色,您可以:
- 修改
- 删除
- 保存适用的选项
1 作者身份(Authorship)
作者资格标准
Science 期刊作者必须满足以下标准,这些标准参考了 国际医学期刊编辑委员会(ICMJE) 的作者定义。
作者必须满足:
每位作者必须:
- 对研究的 构思或设计 做出重要贡献 或
- 参与 数据获取、分析或解释 或
- 开发研究中使用的 新软件 或
- 撰写论文或进行重要修改
并且:
- 批准投稿版本(以及涉及其贡献的修改版本)
- 对自己的贡献负责
- 确保论文任何部分的准确性和完整性问题都得到调查、解决并记录
问题:
我符合上述作者资格标准
选项:
- Yes(是)
- No(否)
通讯作者责任
通讯作者需要:
- 确保所有作者在投稿前已阅读并批准论文
- 与编辑部沟通并接收审稿意见
- 确保数据、材料和代码符合透明性和可重复性标准
- 确保原始数据可以保存并可重新分析
- 确保论文中的数据呈现真实准确
- 减少数据共享的障碍
- 确保所有作者遵守最佳科研实践
- 负责校样确认
- 确保所有作者完成 COI 和许可协议
选择:
- 我不是通讯作者
- 我是通讯作者(但论文不涉及数据或材料)
- 我是通讯作者,并同意承担上述责任
- 我是通讯作者,但无法承担上述责任(需说明原因)
2 作者贡献(Contributions)
请说明你在论文中的贡献。
概念设计(Conceptualization)
研究想法和总体研究目标的制定
Yes / No
方法学(Methodology)
方法或模型的设计
Yes / No
软件(Software)
编程、软件开发、算法实现
Yes / No
验证(Validation)
结果的重复性和验证
Yes / No
正式分析(Formal analysis)
统计、数学或计算分析
Yes / No
实验研究(Investigation)
进行实验或数据收集
Yes / No
资源提供(Resources)
提供试剂、材料、样本、设备等
Yes / No
数据整理(Data curation)
数据管理、整理和维护
Yes / No
论文初稿(Writing – original draft)
撰写初稿
Yes / No
论文修改(Writing – review & editing)
审阅、评论和修改论文
Yes / No
可视化(Visualization)
图表或数据展示
Yes / No
监督(Supervision)
研究监督与指导
Yes / No
项目管理(Project administration)
研究项目协调管理
Yes / No
经费获取(Funding acquisition)
获得研究资金
Yes / No
3 利益冲突声明(Conflict of Interest)
所有作者必须披露可能影响研究客观性的:
- 机构关系
- 资金来源
- 财务利益
这些信息会随论文一起公开。
当前机构
选择:
- 所有机构已列在论文标题页
- 还有其他机构关系,已在致谢中说明
- 还有其他机构关系,将提供给通讯作者
资金来源
选择:
- 我没有为该研究提供资金
- 所有资金来源已在论文致谢中列出
- 还有未列出的资金来源,将提供给通讯作者
财务关系
例如:
- 股票
- 股权
选择:
- 没有财务利益需要披露
- 已在论文致谢中披露
- 还有未披露的,将提供给通讯作者
管理 / 咨询关系
过去 5年内 是否:
- 担任董事或顾问
- 收取咨询费
- 演讲费
- 专家证词费
选择:
- 没有
- 已在致谢中披露
- 还有未披露的
专利
是否是以下专利的发明人:
- 已申请
- 正在申请
- 已授权
选择:
- 没有
- 已在致谢中披露
- 还有未披露的
4 数据政策(Data Policies)
作者需要确认:
论文结论所需的所有数据:
- 已包含在论文或补充材料中 或
- 已存储在公开数据库中
选择:
- 是,我确认
- 不适用(评论文章)
- 我无法确认
- 我将由高级作者回答
高级作者必须:
检查其团队生成的所有原始数据。
5 材料共享(Materials Sharing)
作者需要确认:
论文发表后会合理共享:
- 材料
- 数据
- 代码
选择:
- 是
- 不适用
- 我无法确认
材料转移协议(MTA)
高级作者必须说明:
材料是否受以下限制:
- MTA 协议
- 专利限制
选择:
- 没有限制
- 有限制(已告知编辑部)
- 有限制但未提交协议
6 最终声明(Summary Declaration)
我确认:
- 已阅读所有问题
- 已如实填写
- 所有需要披露的关系已在论文或致谢中说明
如有未列出的关系,已提供给通讯作者。
表单提交时间:
06-Mar-2026
电子签名:
在下面输入姓名即视为电子签名。
Signature: _____
如果你愿意,我可以帮你 快速判断你作为作者通常应该选哪些选项(比如 Conceptualization / Investigation / Writing 等),这样填表只需要 1分钟。
下面是这份 License to Publish(出版许可协议) 的中文翻译。为了便于理解,我做了忠实但更易读的整理。
出版许可协议说明
在稿件被正式接收发表之前,每位作者都必须向 AAAS 提交一份已签署的出版许可协议。
该许可协议授予 AAAS 发表和传播文章所需的权利,同时也保留作者的一些权利。
在提交签署的许可协议之前,请注意以下内容。
我们的理念
美国科学促进会(AAAS)是 Science 系列期刊的非营利出版机构。AAAS 认识到:
- 科研开放性的重要性
- 科学研究日益全球化的特点
经过同行评审的研究成果得到广泛传播,以及科学共同体内部的信息共享,是推动科学服务社会发展的关键。
作为其使命的一部分,AAAS 致力于促进全球范围内:
- 科学家之间
- 工程师之间
- 科学界与公众之间
的交流。
为实现这一目标,AAAS 旗下部分期刊向作者提供以 Creative Commons(知识共享)许可 发表论文的选择。
对于以 Creative Commons 许可 发表的论文,AAAS 将在网上免费开放最终发表版本,不设访问障碍或 embargo(延迟开放期)。
对于未经 Creative Commons 许可发表的同行评审研究论文,作者接收稿(Author Accepted Manuscript)可根据许可协议中规定的条件公开存储到公共数据库中。
AAAS 还会:
- 对具有紧急公共卫生意义的文章立即免费开放
- 参与多项计划,为世界最贫困国家提供免费的科研内容
AAAS 作者出版许可政策
AAAS 的出版许可允许受到 cOAlition S 资助机构支持的研究论文作者,在 AAAS 发表文章后,以 CC BY 许可(或在资助方允许时以 CC BY-ND)公开传播其接收稿版本。
请根据你的情况选择适用的许可类型:
- Standard(标准)
-
U.S. Government Employee(美国政府雇员)
- 美国政府承包商和美国政府资助项目获得者应选择上面的 Standard
- Crown Copyright
- License
Science 期刊出版许可协议
I. 接收发表的前提条件
以下“许可授予协议”(以下简称“本许可”)必须在稿件被 Science 或其姊妹期刊(包括 Science Advances、Science Immunology、Science Robotics、Science Signaling、Science Translational Medicine)接收发表之前签署并交回给 AAAS。
签署本许可即表示你声明并保证:
- 你有权签署本许可
- 你拥有签署本许可所需的一切必要权利
例如:
如果你的机构对出版协议有限制,或者机构主张对教职员工作品拥有某些分发或开放权,而这些权利与本许可条款冲突,那么你必须先从机构获得豁免,解除这些限制后才能签署本许可。
在 AAAS 发表论文后,你所在机构仍可行使本许可 第三部分中保留给作者的权利。
如果该作品版权归你的雇主所有,则必须由:
- 你的雇主 或
- 经授权代表
签署本表格。
如果 AAAS 决定不发表你的稿件,则在 AAAS 以书面形式最终通知你不予发表后,本许可自动失效。AAAS 对是否发表任何稿件以及以何种形式发表拥有完全裁量权。
II. 发表权利
鉴于 AAAS 将发表当前题为:
Complex Human Hair-Bearing Skin Organoids reveal Cell Type Specific Susceptibility and Innate Immune Responses to Herpes Simplex Virus 1(aef5563)
的稿件(以下简称“本作品”),其作者为 Jiabin Huang 等人(以下简称“你”),
你在此授予 AAAS 不可撤销的权利,可出于任何目的(包括商业目的)在全球范围内、以任何语言、任何现有或未来开发的形式和媒介,对该作品进行:
- 发表
- 复制
- 传播
- 传输
- 展示
- 存储
- 翻译
- 创作衍生作品
- 以及其他使用
并允许 / 再许可他人进行上述全部或部分行为。
对于与稿件一起提交的补充材料、数据、音频和/或视频文件,你授予 AAAS 非独占性权利,可对这些补充材料进行上述类似使用。
定义
最终发表版本(Final Published Version / Version of Record / VoR) 指由 AAAS 发表的最终校对、编辑、定稿后的版本。
接收稿版本(Accepted Version / Author Accepted Manuscript / AAM) 指已被 AAAS 接收发表、包含同行评审修改但尚未经过 AAAS 编辑和制作的版本。
权利归属
你同意:
AAAS 对最终发表版本所获得的许可是独占性的。
但你仍然保留以下权利:
可根据你的雇主或研究资助方的“开放获取”政策,向公众提供接收稿版本及更早版本。
你仍保留版权,但须受你授予 AAAS 的上述权利限制。除本许可明确授予的权利外,其余权利均归作者所有。
本许可不转让以下知识产权:
- 专利权
- 商标权
- 其他未明确说明的知识产权
你还授权 AAAS(但 AAAS 无义务)可代表你自费对涉嫌侵犯作品版权的第三方采取维权行动。
III. 作者保留的权利
AAAS 的部分期刊(并非全部)允许作者在接收后选择以 Creative Commons 许可发布最终发表版本。若提供该选项,可能需要支付 文章处理费(APC)。
A. 除 III.B 和 III.C 外,AAAS 发表后,作者及合作者保留以下非独占权利,无需再向 AAAS 申请许可:
- 将最终发表版本收录在作者本人作品的纸质合集里。
- 将最终发表版本用于作者撰写的论文或学位论文中。
- 口头报告最终发表版本的内容。
- 为作者授课使用而复制最终发表版本。若作者在学术机构任职,该机构也可以为教学复制。
- 仅出于非商业目的,向同事分发最终发表版本的复印件或 PDF(且需告知接收者不得再次传播或复制)。
- 在作者未来作品中重复使用自己制作的图和表。
- 作者可为任何目的、以任何格式使用或授权使用与本作品相关的补充材料。
- 如果文章不是同行评审研究论文,则文章发表后可立即将接收稿版本发布到个人网站或雇主网站,但必须附上最终发表版本链接,并注明: “这是作者版本,仅供个人使用,不得再传播。正式版本发表于 Science Advances,日期 [date];doi: 10.1126/sciadv.aef5563。” 且不得将接收稿修改得像出版社排版后的正式版本。
-
如果文章是同行评审研究论文,则文章由 AAAS 发表后,你可以将接收稿版本发布到个人网站或任意公共数据库中(但不得修改得像正式出版版本)。同时必须附上正式版本链接及适用的许可说明:
- a. 如果稿件在 2021年1月1日或之后 提交至 Science 订阅期刊,且研究受到 cOAlition S 资助,可对接收稿使用 CC BY 许可(若资助方允许,也可使用 CC BY-ND)。
- b. 如果 a 不适用,但稿件在 2023年1月1日或之后 提交,并且受雇主或资助方开放获取政策约束,要求接收稿以 CC BY 发布,则可使用 CC BY。
- c. 如果 a 和 b 都不适用,则你必须在传播的接收稿上注明: “这是作者版本,仅供个人使用,不得再传播。正式版本发表于 Science Advances,日期 [date];doi: 10.1126/sciadv.aef5563。”
B. 如果 AAAS 在稿件接收后提供了 CC BY(知识共享署名 4.0 国际许可) 选项,且你选择了该选项并支付了适用 APC:
那么在论文发表后,你和合作者可以按照 CC BY 许可允许的方式使用文章,但必须遵守该许可的全部条款。
C. 如果 AAAS 在稿件接收后提供了 CC BY-NC(知识共享署名-非商业性使用 4.0 国际许可) 选项,且你选择了该选项并支付了适用 APC:
那么在论文发表后,你和合作者可以按照 CC BY-NC 许可允许的方式使用文章,并在适用时享有上面 III.A 中列出的权利。
IV. 用户访问与使用权(仅适用于以 Creative Commons 许可发表的作品)
如果 AAAS 以 Creative Commons 许可 发表最终发表版本,则:
- AAAS 将无障碍、无 embargo 地免费在线开放该最终版本
- 发表后,AAAS 还会将最终发表版本提交至 PMC/UKPMC 以便立即公开
AAAS 将按照接收后作者所选的 Creative Commons 许可发表作品。其他人对最终发表版本的使用应遵守所选许可条款。
A. CC BY
允许用户在任何媒介和格式中:
- 复制
- 再分发
- 改编
- 混编
- 商业使用
但前提是必须:
- 署名作者和原作品
- 说明是否作了修改
- 不得暗示作者认可该用途
- 并附上 CC BY 4.0 许可链接
B. CC BY-NC
允许用户在任何媒介和格式中:
- 复制
- 再分发
- 改编
- 混编
但仅限非商业用途,不得用于商业利益或金钱报酬。
同样要求:
- 署名
- 说明修改
- 不得暗示作者认可
- 并附上 CC BY-NC 4.0 许可链接
V. 作者的额外声明与保证
你声明并保证:
- 本作品是由你原创撰写的
- 其中所有事实真实准确
- 作品不包含诽谤性内容
- 作品未在其他地方发表过
- 作品不侵犯任何第三方的版权、财产权或人身权
- 未使用人工智能、机器学习或类似算法工具生成作品中的图像、图表、图形或多媒体内容,除非在投稿时已向 Science 期刊编辑充分披露,并得到 AAAS 批准
- 如果人工智能、机器学习或类似工具用于研究本身,或用于作品撰写或呈现,则必须按照 Science 当前出版政策,在投稿时于投稿信和稿件中说明
你同意,如因上述保证产生任何索赔,你将对 AAAS 进行赔偿、抗辩并使其免责。
VI. 第三方内容
重要: 如果作品中包含任何由第三方拥有或控制的材料,你必须:
- 获得使用许可
- 向编辑提交该许可的书面证明
- 并在作品正文中清楚标明该材料的来源和版权归属
签署本许可即表示你保证你有充分权力签署本协议。
本许可在作品版权保护期内持续有效,除非双方明确书面同意,否则不得撤销。
本许可受美国哥伦比亚特区法律管辖并据其解释,任何争议也依该法律解决,而不适用其冲突法原则。
如适用,请填写以下内容
本作品是否是在美国政府合同或资助下完成:
US Government Contract or Grant
AAAS 承认: 若某项资助或合同规定美国政府拥有将该作品用于非商业政府用途的非独占权利,则美国政府可行使该权利。
如果你愿意,我可以继续帮你做一版 “这份 License 你真正需要关心的 5 个重点”,中文、两分钟看完。
德国父母探亲签证完整材料包(最终版)
直接按这个顺序装订/分组,给父母递签用。材料顺序依据你上传的德国使馆官方清单,并结合目前的情况:有邀请信 + 有 Verpflichtungserklärung + 父母为退休人员。
德国父母探亲签证完整材料包(最终版)
一、父母每人各自准备的一套材料
1. 护照
每位申请人准备:
- 护照原件
- 护照身份页复印件 1份
要求是护照有效期需超过计划离开申根区日期至少3个月,且至少有2页空白签证页。
2. 申根签证申请表
每位申请人准备:
- VIDEX 在线填写后打印
- 申请表亲笔签名
- 附加声明页亲笔签名
- 关于《居留法》第54条第2款第8项的声明书签字
签名要和护照签名一致。
3. 证件照
每位申请人准备:
- 1张白底生物识别照片
- 6个月内拍摄
4. 医疗保险
每位申请人准备:
- 保险单打印件 1份
要求:
- 覆盖整个申根区
- 覆盖整个停留期间
- 保额不低于 3 万欧元
- 明确保门诊、住院、送返等内容。
你前面说保险由你购买,这样是可以的。
5. 户口本
每位申请人可共用/分别提交:
- 户口本所有非空白页复印件
中国籍申请人无需翻译。
6. 退休人员材料
每位申请人建议准备:
- 退休证复印件
- 养老金证明或退休金流水(有的话更好)
- 回国约束力说明 1份 (这个不需要)
官方清单里说明“退休人员材料不同”,退休人员不走在职证明那一套,所以不需要在职证明和营业执照。
二、由你提供、父母带去递签的材料
7. 邀请信
准备:
- 邀请信原件
- 复印件 1份
内容需包括邀请人地址和联系方式、旅行目的、时间、停留地点、费用承担、关系说明,并有亲笔签名和日期。
你这份已经做好了。
8. Verpflichtungserklärung
准备:
- 原件
- 复印件 1份
这是官方认可的“旅行和停留费用承担证明”之一。你们有这个之后,通常就不再需要父母自己提供第7项银行流水作为旅费证明。
9. 邀请人身份证明材料
按德国使馆要求,非德籍邀请人需要提交:
- 护照身份页复印件
- 德国有效居留许可复印件。
你这部分已经整理成 A4 版了,正好可以直接放进去。
三、关系证明材料
10. 亲属关系证明
准备:
- 亲属关系公证书原件
- 复印件 1份
- 德文或英文翻译
- Apostille(附加证明书/海牙认证)
使馆对“经常探访在德国生活的亲属”要求的是: 经公证处翻译公证并办理了附加证明书(Apostille)的亲属关系证明(原件+复印件)。
四、可选但强烈建议准备
11. 旧申根签证记录
如果父母以前去过申根区,准备:
- 旧护照
- 或旧签证页复印件
这项是“如适用”,不是强制。
12. 回国约束力辅助材料
虽然官方清单没单列“回国约束力”这一项,但实际审核很看重。建议每位家长再补:
- 退休证复印件
- 养老金证明/银行流水(可选)
- 户口本复印件
- 房产证复印件(有就交)
- 回国约束力说明 1份
这类材料对退休人员很有帮助。
你父母这次通常不需要准备的材料
因为你已经提供了 Verpflichtungserklärung,所以通常不需要再交:
- 申请人银行流水
- 存款证明
- 工资流水
- 在职证明
- 公司营业执照
官方第11项已经写明: 旅费可以由申请人自己承担并参考第7项,或者由邀请人根据《居留法》第66至68条承诺承担。你们走的是后者。
最推荐的装订顺序
给每位家长各做一套主材料,顺序如下:
A. 申请人本人材料
- 护照原件
- 护照首页复印件
- 申请表
- 签字声明页
- 照片
- 医疗保险
- 户口本复印件
- 退休证复印件
- 旧申根签证材料(如有)
- 回国约束力说明 (这个不需要)
B. 邀请与担保材料
- 邀请信原件/复印件
- Verpflichtungserklärung 原件/复印件
- 你的护照复印件
- 你的德国居留许可复印件
C. 关系证明
- 亲属关系公证原件
- 翻译件
- Apostille
- 上述材料复印件
最后给你一个递签实操建议
最稳妥的做法是:
- 父亲一套
- 母亲一套
- 共用材料各自都放复印件
- 原件单独放一个透明文件袋
这样 VFS 收材料时最省事,也最不容易漏。
Consider 做成一份 可打印的中文勾选版 Checklist。
探亲访友申根签证申请须知 (2024 年 6 月版)
这个文件包含: 递签材料做成完整的A4材料包结构(非常有用):
例如:
01 Passport
02 Application form
03 Photo
05 Insurance
06 Hukou
06 Relationship proof
07 退休证+须提交退休证(原件 + 复印件)以及固定的退休金收入证明
10 Invitation letter
11 Verpflichtungserklärung
12 Relationship proof
13 Passport copy of inviter
14 old visa copy
-
旅行护照(原件+1 份身份信息页的复印件) 亲笔签名的旅行护照(护照有效期超过申请停留期至少 3 个月,至少有两页空白签证页,无破损)。
-
申请表(原件) 签名须和护照签名一致。
-
1 张证件照片 1 张近期(6 个月内)拍摄的白色背景生物识别证件照。要求如下:尺寸为4.5厘米 x 3.5 厘米,要求高分辨率和白色背景。包含下巴和脖子的正面照,脸部和眼睛不得有遮挡,脸部在照片上占比70-80%。
-
旅行医疗保险(原件)
-
户口本(复印件) 所有非空白户口页复印件,无需翻译
-
退休证+须提交退休证(原件 + 复印件)以及固定的退休金收入证明。
-
邀请信(原件)
-
VE
-
申请人与邀请人的关系证明 经常探访在德国生活的亲属: 经公证处翻译公证并办理了附加证明书(Apostille)的亲属关系 证明。2023 年 11 月 30 日前通过中国外交部/地方外办进行了领事认证的中国公文书仍可用于申办本签证,无需额外办理附加证明书。(原件+复印件)
-
邀请人的身份证明材料(复印件) 邀请人德国身份证或护照身份信息页的复印件。非德籍邀请人还须另外提交德国有效居留许可的复印件。
-
如适用:曾前往申根区旅行的证明材料 例如提交旧护照或提交以往签证和出入境记录复印件。
How to search for motifs in Acinetobacter?
To search for those short peptide motifs (like “DIKDY” or “DLSDY”) across all available Acinetobacter genomes, you can use the online BLAST tool on the NCBI website. Since these are short sequences (5-7 amino acids), you’ll need to adjust the search settings to find meaningful matches.
Here is a step-by-step guide on how to perform this search effectively:
1. Access NCBI BLAST and Choose the Correct Program
First, go to the NCBI BLAST home page and select the appropriate search tool. For protein motifs, you should use blastp.
- Go to the NCBI BLAST home page.
- Under the “Protein BLAST” section, click on “blastp” .
2. Enter Your Query Sequence
In the “Enter Query Sequence” box, you can directly type or paste your short peptide sequence, such as DIKDY .
- Important: For each search, use only one of the short peptide motifs you mentioned (e.g., first search for “DIKDY”, then later for “DNYQFDSK”, etc.).
3. Select the Database and Restrict by Organism
This is the most important step to ensure you search only Acinetobacter genomes.
- In the “Choose Search Set” section, select the
Non-redundant protein sequences (nr)database. This is the comprehensive database of all protein sequences at NCBI. - In the “Organism” box, type “Acinetobacter” (or “Acinetobacter baumannii”).
- Select the desired option from the dropdown menu that appears (e.g., Acinetobacter (taxid:469) ) . This will restrict your search to only sequences from this genus.
4. Optimize the Algorithm for Short Sequences
Standard BLAST settings are optimized for long sequences and may miss short motifs. You must change the algorithm to one designed for short inputs.
- In the “Program Selection” section, click on “Choose Search Set” or “Algorithm” to see more options.
- Select the
blastp-shorttask. This program is specifically optimized for query sequences shorter than 30 residues .
5. Adjust Advanced Parameters (Optional but Recommended)
You may also want to adjust the Expect threshold (E-value) to get more relevant results. A higher E-value is more lenient and can find more distant matches, which is useful for short, conserved motifs .
- Click on “Algorithm parameters” to expand the advanced settings.
- Increase the Expect threshold to
20000or200000. The default value of 10 is too stringent for a 5-amino acid query. - Consider turning off the low-complexity region filter, as short motifs might be filtered out by default.
6. Run the Search and Interpret the Results
Click the “BLAST” button at the bottom of the page.
- The results page will show you all protein sequences in Acinetobacter that contain your exact peptide motif.
- Pay attention to the “Query Cover” column. For a perfect 5-amino acid match, the query cover will be 100%. If you allowed for mismatches, it might be lower.
- Look at the “Scientific Name” column to see which Acinetobacter species and strains contain the motif .
Summary of Settings for Your Search
| Parameter | Recommended Setting | Reason |
|---|---|---|
| Program | blastp | To search a protein query against a protein database . |
| Database | Non-redundant protein sequences (nr) | The most comprehensive public database. |
| Organism | Acinetobacter (taxid:469) | To limit results to your genus of interest . |
| Task | blastp-short |
Optimized for short, peptide-like queries . |
| Expect threshold | 20,000 | Increases sensitivity to find short, exact matches. |
By following these steps for each of the eight peptide motifs (four from AdeJ and four from AdeB), you will be able to see how conserved they are across different Acinetobacter strains and identify which specific genomes contain these regions of interest.
I hope this step-by-step guide helps you perform your analysis successfully. If the results are too broad or too narrow, feel free to adjust the E-value or experiment with allowing a small number of mismatches in the algorithm parameters.