很多人第一次在 NCBI 点“Start a new submission”会懵：这么多入口到底选哪个？下面给你一棵从目标出发的决策树，按着走基本不会错。如果你要公开的是“数据文件”（FASTQ/FASTA/组装/注释），不要选 GTR；如果你要公开的是“某个临床/研究检测项目的服务说明”，才选 GTR。
✅ 第一步：你要提交的是“原始测序数据”还是“组装/注释结果”？
A. 我有 FASTQ（原始 reads：Illumina/Nanopore/PacBio）
➡️ 选 Sequence Read Archive (SRA)
- 你提交的是：reads + 文库信息（平台、PE/SE、策略等）
- 几乎所有文章要求原始数据可复现，都需要 SRA
同时你通常还需要：
- BioSample（每个样本的“身份证”）
- BioProject（把整个项目的数据串起来）
✅ 常见路径：BioProject → BioSample → SRA
B. 我有组装好的基因组（contigs/scaffolds/complete genome）
➡️ 选 Genome（基因组提交主入口）
- 适合：细菌/真菌/病毒/真核的 draft 或 complete genome
- 会与 GenBank/Assembly 体系关联（后续可公开检索引用）
同时通常还需要：
- BioSample（样本来源信息）
- BioProject（项目汇总）
- （可选但强烈建议）SRA（如果你也愿意公开原始 reads）
✅ 常见路径：BioProject → BioSample → SRA（可选/建议）→ Genome
C. 我只有一个基因/片段/质粒序列（不是整套基因组项目）
➡️ 选 GenBank
- 适合：单基因、片段序列、单独的质粒序列、特定区域序列
- 如果你在做“系统的基因组项目”，通常走 Genome 更合适；GenBank更像“序列条目提交”。
D. 我有转录组拼装结果（assembled transcripts，不是 reads）
➡️ 选 TSA（Transcriptome Shotgun Assembly）
- TSA 提交的是：拼装后的转录本序列
- 原始 RNA-seq reads 仍应走 SRA
✅ 常见路径：BioProject → BioSample → SRA → TSA
✅ 第二步：你提交的是“临床敏感人类数据/变异解释/检测项目”吗？
E. 数据涉及人类受试者隐私、需要受控访问（表型+基因型/临床队列）
➡️ 选 dbGaP（受控访问）
- 适合：人类敏感数据
- 常伴随伦理/权限/审查流程（不是完全公开下载）
F. 你要提交“变异的临床意义解读”（致病性、证据、表型关联）
➡️ 选 ClinVar
- 适合：临床实验室/研究团队共享变异解释
G. 你要登记“遗传检测项目/检测服务信息”
➡️ 选 GTR（Genetic Testing Registry）
- 更像“检测项目注册”，不是上传测序数据本体
✅ 第三步：你是不是在管理一个“项目集合”？
H. 你有多个样本/多批数据/多类型数据（SRA + Genome + 其它）
➡️ 建议先建 BioProject
- 作用：项目总目录，方便引用与检索
I. 你每一个样本都需要可追溯的元数据（来源、地点、日期、宿主等）
➡️ 基本都需要 BioSample
- 作用：样本身份证；SRA/Genome 通常都要挂它
终极“快速选择口诀”
- FASTQ 原始 reads → SRA
- 基因组组装（contigs/scaffolds/complete）→ Genome
- 转录本拼装（transcripts）→ TSA
- 单基因/片段/质粒序列条目 → GenBank
- 把所有东西串成一个项目 → BioProject
- 每个样本来源信息 → BioSample
- 人类敏感受控数据 → dbGaP
- 临床变异解释 → ClinVar
- 遗传检测项目登记 → GTR
- 批量/自动化 → API
下面是对 GTR（Genetic Testing Registry，遗传检测注册库） 的更详细中文说明。
GTR 是什么？
GTR 是 NCBI 上一个“登记遗传检测项目/检测服务信息”的公共目录，由提供检测的实验室/机构自愿提交，目的是让公众、临床医生和研究人员能查到：某个疾病/基因/病原体有哪些检测、由哪些实验室提供、检测方法是什么、适用范围和证据如何等。(NCBI)
关键点：GTR 不是用来上传 FASTQ/基因组序列的。
- 原始测序数据 → SRA
- 基因组组装/注释 → Genome / GenBank
- GTR → 登记“检测项目本身”的信息（类似检测项目黄页/目录） (NCBI)
GTR 收录哪些“检测”？
GTR 的范围不仅是传统“单基因遗传病检测”，也包括：
- 孟德尔遗传病、药物反应（药物基因组学）相关检测
- 肿瘤/体细胞变异检测
- 多基因 panel、芯片（array）、生化、细胞遗传、分子检测 (NCBI)
- 微生物/病原体相关检测（例如病原体 panel、病毒载量、血清学抗体/抗原检测等） (NCBI)
在 GTR 里，一个“检测条目”通常会包含哪些信息？
你可以把它理解为“一个检测项目的说明书 + 实验室信息”组合，常见字段包括：
- 检测目的/用途：诊断、携带者筛查、预后、用药指导等 (NCBI)
- 检测对象（Target）：基因/区域、变异类型、或病原体靶标等
- 方法学（Methodology）：例如 PCR、Sanger、NGS panel、MLPA、芯片、qPCR、Nanopore 等（写清楚平台与策略）(NCBI)
- 适应证/关联疾病（Indication/Condition）：对应哪些疾病/表型；并可建立“检测—靶标—适应证”的声明关系 (NCBI)
- 性能与证据：分析/临床有效性、参考文献、指南或标准等（GTR强调用途与证据展示）(NCBI)
- 实验室信息：机构名称、联系人、资质/认证信息、可提供的服务范围等 (NCBI)
- GTR accession：每个检测都有唯一编号，便于在论文/EHR 中引用。(NCBI)
谁应该提交 GTR？
主要是提供遗传/分子检测服务的实验室或机构（临床检验科、第三方医学检验所、商业检测机构、研究机构实验室等）。(NCBI)
如果你只是做科研并想公开数据：
- 数据公开通常走 BioProject/BioSample + SRA + Genome/GenBank
- 不一定需要 GTR（除非你在对外提供一个“检测项目/检测服务”）(NCBI)
GTR 怎么提交？（流程概览）
GTR 提交一般是两步走：
1）先注册“实验室（Laboratory record）”
先把实验室作为一个实体登记，GTR 会审核/联系新注册者；实验室通过后才可以提交具体检测项目。(NCBI)
2）再提交“检测（Test record）”
有两种方式：
- 网页交互式提交：在提交门户里逐页填写信息（适合少量检测）(NCBI)
- 批量提交（Excel 模板）：适合大量临床检测项目；可用全字段或最小字段模板上传（研究检测的批量上传通常不开放/不支持）。(NCBI)
GTR vs ClinVar vs dbGaP：最容易混淆的三兄弟
- GTR：登记“检测项目/检测服务”信息（谁提供、怎么测、测什么、适应证/证据）(NCBI)
- ClinVar：提交“变异—临床意义”的解释与证据（致病性分类等）（你贴里之前也提过）
- dbGaP：人类敏感数据（基因型/表型）受控访问的归档库